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小鼠心脏发育相关基因调控网络的生物信息学分析
《生物医学工程研究》[ISSN:1006-6977/CN:61-1281/TN]
- 期数:
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2011年02期
- 页码:
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0
- 栏目:
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论著
- 出版日期:
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2011-04-09
文章信息/Info
- Title:
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- 作者:
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张慧;陆祖宏;
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东南大学生物电子学国家重点实验室;
- Author(s):
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- 关键词:
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小鼠; 心脏发育; 基因调控网络; 生物信息学; 转录因子
- Keywords:
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- 分类号:
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- DOI:
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- 文献标识码:
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- 摘要:
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Nkx2.5,Mef2c,Gata4/5/6,Tbx5和Hand1等基因作为脊椎动物心脏发育相关基因调控网络的核心基因,对脊椎动物的心脏发育起核心调控作用。本研究主要通过对小鼠心脏发育相关核心基因的生物信息学分析,研究Nkx2.5,Mef2c,Gata4,Gata6,Tbx5和Hand1等核心转录因子之间的相互调控关系,得到小鼠心脏发育的核心基因调控网络(GRNs)。与文献中总结的小鼠的GRNs作比较,发现Nkx2.5在小鼠心脏发育基因调控网络中的核心地位没有改变,并且Nkx2.5在网络中主要扮演了调控者的角色,它直接调控很多转录因子。Gata4是另一个主要起调控者作用的转录因子。另外小鼠的Mef2c和Hand1处于被多个转录因子调控的地位。变化比较大的是Tbx5所涉及的调控网络,主要有两点:Nkx2.5对Tbx5的表达有没有调控作用以及Tbx5对自身的表达有没有调控作用。研究表明生物信息学分析对具体实验研究有一定方向性指导意义。
- Abstract:
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更新日期/Last Update:
2011-04-09